行政院昨天（16號）宣布新任教育部長人選，由中研院院士吳茂昆接任教長一職，週四就要上任，不過現在卻被起底，他在擔任東華大學校長期間，惹出不少爭議，包括涉嫌溢領教授獎助金、公開支持兩國論、還曾經數度到大陸講課，甚至曾在中國國務院底下的中科院擔任顧問，現在連前總統府副秘書長羅智強也在臉書爆料，2004年，中國軍方科研生產基地的一名技術顧問，也叫吳茂昆，如果兩人是同一人，檢調和行政院長賴清德，就得好好的查一查。吳茂昆晚間發表聲明駁斥，這完全是莫須有的指控!
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大陸產學合作小組成立，學者們排排座，拍下團體照，坐在第一排的，就是即將接任教育部長的中研院院士吳茂昆，現在卻被起底，曾經在中國國務院底下的中科院，擔任顧問。吳茂昆趕緊自清，不過現在有網友加碼報料，吳茂昆擔任東華大學校長期間，曾經到北京清華大學開設講座，連浙江大學、南京大學，也都有相關講學紀錄。雖然事後澄清，一切符合校方規定，但赴中講課疑雲，和教育部卡管原因情況類似，就連執政黨自家立委都認為，新任教長上任前，應該先解釋清楚。除了中科院和開設講座的傳聞，前總統府副秘書長羅智強也在臉書PO文，吳茂昆2004年擔任國科會主委期間，竟然身兼中國「西部超導材料科技有限公司」的技術顧問，而「西部超導」的母公司，則是西北有色金屬研究院，也是大陸「軍用」稀有金屬科研的生產基地，羅智強要相關單位趕緊調查，如果傳言屬實，呼籲北檢介入調查，有無違法以及涉及洩密。